Для добавления закладки, выберите папку в дереве файлов, нажмите правую кнопку мыши и выберите команду Добавить в закладки контекстного меню.

       Выбор пункта меню Редактировать закладки... или нажатие соответствующей кнопки в панели инструментов открывает/закрывает редактор закладок. В выпадающем меню отображаются пункты с непустым "Именем закладки", т.е. для удаления закладки и меню достаточно очистить ее поле "Имя закладки" в редакторе.